Физиология тұрғысынан аутогендік жаттығулар қозғау мен тыйым салу процестерін бақылауға мүмкіндік береді, олардың теңдестіруіне қол жеткізеді. Бұл техниканың үнемі қолданылуымен организмнің қоршаған ортаның өзгеруіне жылдам бейімделу қабілеті артады, ақыл-ой процестерін белсендіреді, жүйке жүйесінің жұмысы қалыпқа келтіріледі, жады жақсарады. Ауырлық синдромын жоюға, ауысқан стресстен кейін организмнің қалыпты эмоционалдық жағдайын қалпына келтіруге, есте сақтау мен көңіл көтеруді жетілдіруге арналған аутогендік жаттығулар өте маңызды. Терапевтік мақсаттарда бұл әдіс невроздар мен басқа да функционалдық бұзылулар, сондай-ақ организмнің негізгі жүйелерінің жұмысын қалыпқа келтіру және метаболизм процестерін реттеу үшін қолданылады.
Автожүрістерді үйрету және үйрену үшін барлық адамдар дерлік қол жетімді. Дененің қалыпты жұмыс істеуі үшін осы психо-гигиеналық техниканың маңызы жай ғана құнды болып табылады, ал жаттығу үшін арнайы техника немесе тренажер қажет емес, сондықтан аутогендік жаттығу әдістерін үйренгісі келетіндерге бұл жаттығуларға тәулігіне бірнеше минут ғана болады. Дегенмен, тіпті қысқа уақыт ішінде бұлшықеттердің дұрыс шиеленісіп, босаңсуына, таңдалған нысанға шоғырлануға, эмоционалды жағдайды реттеуге, жүйке жүйесінің автономды бөлігінің қалыпты жұмысын қамтамасыз етуге және ішкі органдардың функционалдық жағдайын бақылап отыруға жеткілікті болады.
Автогендік жаттығулардың негізгі бөлігі ауызша сөйлеу процесі болып табылады, онда ауызша формалар қолданылады. Фразалар бірінші тұлғаның сингулярлық тұсында міндетті түрде айтылуы керек, яғни олар шамамен мына сияқты бастау керек: «Мен тынышмын ... сенімдімін ...» және т.б. Автогендік жаттығу ережелеріне сәйкес, мұндай фразаларда бөлшектерді «жоқ», яғни «Мен науқас емеспін» деген сөйлемнің орнына, «мен дені сау» деп айтуым керек және «Мен мүлдем алаңдамаймын» дегенді айту керек, «Мен мүлдем тынышмын» деп айтуға болады. Және бұл өрнектер белгілі бір тәртіпте айтылуы керек. Жаттығудың басында жаттығулар демалыспен және босаңсумен айналысу керек, содан кейін денеге мақсатты әсер ететін және сеанстың негізгі психотерапевтік міндеттеріне қол жеткізуге көмектесетін сөз тіркестерін және жаттығу аяқталғаннан кейін демалуға және мобилизациялық әсерге ие болуға тиіс сөздер. Техниканы дұрыс орындаған кезде, адам жарты жартысы бар күйге түседі, сол кезде өзін-өзі қамтамасыз ететін өзін-өзі гипнозы орын алады, бұл қалыпты дене жұмысын сақтауға көмектеседі.
Эмоциялық жағдайдың әртүрлі түрлерімен бір немесе бірнеше бұлшықеттер тобын жоғарылату анықталды. Мысалы, көңіл-күй нашар болса, тыныс алу жүйесінің бұлшықетінде шиеленіс күшейіп, қорқынышпен бұлшықеттердің кернеуі артады. Демек, белгілі бір бұлшықеттің релаксациясының аутогендік жаттығуларына қол жеткізу үшін, ағзаның қалыпты жұмыс істеуін және оның психологиялық жай-күйін жақсартуды қамтамасыз етуге болады. Осылайша, бұлшықет топтары мен организмнің эмоционалды жағдайының арасындағы байланысты невроэмоционалды тозуды айтарлықтай азайтуға, шаршауды азайтуға және осылайша қажетті тиімділік деңгейін жылдам қалпына келтіруге мүмкіндік береді.
Авто-жаттығулардың қарапайымдылығына қарамастан және дененің қалыпты жұмыс істеуі үшін оның үлкен оң мәніне қарамастан, бұл техниканы қолдануда қиындықтар бар. Мысалы, 12 жасқа дейінгі балалар үшін аутогенді оқытуды жиі тиімсіз деп санайды, өйткені осы жас кезеңінде өзіңіздің жеке басыңызға қатысты жеткілікті түрде саналы қарым-қатынас жоқ. Қарттар да осы психо-гигиеналық техниканы меңгеруге тырысуда кейбір қиындықтар туындауы мүмкін, өйткені жасына қарай бұлшық еттердің тонусы тұрақты түрде азаяды және бұлшықеттердің релаксациясын бақылау әлдеқайда күрделі болады.